畜牧兽医学报 ›› 2016, Vol. 47 ›› Issue (7): 1373-1380.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.07.009
耿红红,张敬旸,李莲,王根林*
GENG Hong-hong,ZHANG Jing-yang,LI Lian,WANG Gen-lin*
摘要:
本研究旨在利用RNA-seq技术对不同季节槟榔江水牛全血mRNA进行分析,找出不同季节精液品质候选基因。选取5头生长状况相近的3~5岁槟榔江水牛,进行春、夏、秋、冬4个季节的精液品质(鲜精活力、精子畸形率、射精量、精子密度)检测。根据精液品质,选取差异极显著的春(BL)、夏(SBL)两个季节的水牛样品进行RNA-seq转录组测序分析。颈静脉采集全血,抽提mRNA并组内混合制样,利用RNA-seq技术分析不同季节槟榔江水牛全血mRNA差异表达。根据差异倍数>1.5,P<0.05的标准进行筛选,得到差异基因,再利用DAVID 6.7软件对差异基因进行GO和KEGG分析,通过RT-PCR验证基因芯片结果的准确性。结果表明:差异表达基因84个,其中上调基因56个,下调基因28个;GO分析发现,这些差异基因与应激反应、免疫反应有关;KEGG分析表明,差异基因显著富集到肿瘤坏死因子(TNF)和T细胞受体信号通路。其中,神经营养因子受体类似物死亡结构域(NRADD,又叫热休克蛋白因子1 (HSF1))、原癌基因FOS和JUN,与精液品质相关性强,可作为进一步研究的靶基因。
中图分类号: